BioHackathon 2017 開催のご案内

JST バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) とライフサイエンス統合データベースセンター
(DBCLS) が主催する BioHackathon
は、バイオインフォマティクスに関連する技術開発を1週間の合宿形式で行う会議です。本年はシンポジウムを
9/9-10 に東京で、ハッカソンをいわて東北メディカル・メガバンクのご協力で、9/11-16
に岩手県盛岡市にて開催します。

The 10th NBDC/DBCLS BioHackathon
http://2017.biohackathon.org/

日程:
* 9月9日 (土) ~ 10日 (日) 公開シンポジウム @ 東京都市ヶ谷
JSTサイエンスプラザ
* 9月11日 (月) ~ 16日 (土) ハッカソン @ 岩手県盛岡市 ホテル大観
(http://www.hotel-taikan.com)

NBDC/DBCLS はこれまでの十年間、BioHackathon
の開催によって日本国内の研究者と海外の研究者がコラボレーションする場を提供してきました。配列解析を始めとするバイオインフォマティクスの解析技術から、データ形式の標準化やデータベース連携のための技術開発、文献データの利用技術、高度な質問応答システムなど、これまでに
BioHackathon によって生まれた成果は多岐に渡ります。10周年となる今回の BioHackathon
では2日間のシンポジウムを通して、バイオインフォマティクスとデータベースのこれまでの10年間を振り返り、同分野における今後の国際連携の在り方について議論します。続く5日間のハッカソンでは、例年と同じく多様なトピックについて、集中した議論と開発が行われることを期待しています。これまでに参加されたことのない方も、是非この機会にご参加ください。シンポジウムだけの参加も歓迎します。

シンポジウム、ハッカソン共に参加費は無料です。ハッカソンの交通費や食費・宿泊費については自費となります。参加を希望される方は、下のページから参加登録をお願いいたします。参加登録の締切は
7/31 となっています。
http://2017.biohackathon.org/registration

その他、不明な点があれば 2017-admin@biohackathon.org
までお知らせください。どうぞよろしくお願いします。


The 10th NBDC/DBCLS BioHackathon
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* BioHackathon 2017: http://2017.biohackathon.org/

OVERVIEW
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BioHackathon 2017 (BH17) will be held in Tokyo and Morioka, Iwate, Japan
from Sep 9th to 16th, 2017.

NBDC and DBCLS have been organizing annual BioHackathons since 2008,
mainly focusing on standardization and interoperability of bioinformatics
data and web services for improving integration, preservation and
utilization of databases in life sciences.

This year, we will host the hackathon in Morioka with a generous support
from the Iwate Medical University where our collaborators are conducting
a cohort project for Japanese populations.

OBJECTIVES
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From the experiences obtained through a series of BioHackathons, we have
chosen the Semantic Web as a key technology for improving integration and
utilization of data. As a result of ourcommunity efforts, A number of major
databases have been publicly available as RDF resources, e.g,

* DNA sequences and annotations: INSDC (DDBJ), Ensembl
* Protein sequences and annotations: UniProt
* Protein 3D structures: PDB
* Chemical substances: PubChem, ChEMBL
* Pathways and interactions: Reactome, PSICQUIC
* Biomedical databases: ClinVar, ExAC, MedGen
* Text resources: MeSH, PubAnnotations
* and more ...

and, now it is demanded to create applications based on them, while we also
continue developing tools, ontologies and RDF data as we have done in the
previous BioHackathons.

Topics and targets which may be included by this BioHackathon can be found
at http://2017.biohackathon.org/hackathon and we are also open to accept
any relevant issues which our community currently faces.

DATES & VENUE
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On the first two days, we will have a extended public symposium for
the 10th anniversary in Tokyo. Then we will move to Morioka for software
development and discussions for five days. On the last day, we plan to
have a session for summarizing a meeting report.

Symposium: Sep 9 (Sat) - 10 (Sun) in Tokyo
Hackathon: Sep 11 (Mon) - 15 (Fri) in Morioka
Writethon: Sep 16 (Sat) in Morioka

The hackathon will be took place at the hotel Taikan which is located
at the country side of Morioka city where we can stay together and
focusing on coding.

NOTICES
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As a general requirement, participants are requested to attend the meeting
for its entire schedule to maximize the effectiveness of the hackathon and
to reduce logistics problems.

Note that we need to ask your kind understanding for sharing a hotel room
with other participants because the venue doesn't have enough single rooms.

Also, we'll make announcements and have discussions related to the hackathon
on the mailing list at http://groups.google.com/group/biohackathon so
if you are new to our BioHackathon, please subscribe to the list.