特任助教(常勤)募集(メタゲノム分野)

このたび東京大学医科学研究所国際粘膜ワクチン研究開発センターにて、ヒト腸内微生物叢のシークエンスデータ解析研究に従事する特任助教、もしくは特任研究員(常勤)を下記の要領で募集します。

 

1.職名

 特任助教、もしくは特任研究員(常勤)(本人のキャリアにより決定)

 

2.研究分野

  • ヒト腸内微生物叢シークエンスデータから有用な情報を抽出するアルゴリズム・ソフトウェアの開発
  • 大規模メタゲノムシークエンスデータのスーパーコンピュータを用いた解析

 

3.研究内容

ヒトの腸内には100兆を超える数の細菌が存在し、そのバランスがさまざまな疾患や薬剤応答等と関係していることが分かってきました。また、腸内には、細菌だけではなく多様なウイルスも膨大な数存在し、それらの多くは細菌に感染するバクテリオファージです。我々の研究グループでは、ヒト腸内細菌叢に加えウイルス叢も次世代シークエンサーにより網羅的に計測する技術を開発し研究を進めています。細菌叢、ウイルス叢のメタゲノムデータを、さまざまな疾患を対象に計測することで、これまで細菌叢だけでは分からなかった疾患に関わる腸内微生物の複雑なエコシステムを明らかにすることを目標としています。また、見出した腸内微生物のシステムを用い細菌叢をコントロールし、疾患に対する画期的な予防法、治療法に繋げるための研究を行います。例えば、ある疾患の原因となる細菌に特異的に感染し、その菌を溶菌してしまうバクテリオファージを発見できれば、新しい治療法に繋がる可能性があります。細菌叢・ウイルス叢のメタゲノムシークエンスデータを用いてこのような関係を見いだすことは、本研究の目標の一つです。

本公募では、これらのヒト腸内微生物叢の研究においてメタゲノムシークエンスデータを解析すると共に、新たなデータ解析技術・アルゴリズム・ソフトウェアの開発を行う研究者を募集します。なお、計算資源としては、東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センターに設置されている SHIROKANE の利用が可能です。

 

4.募集人員

1〜2名

 

5.勤務地 

〒108-8639 東京都港区白金台4−6−1

東京大学医科学研究所国際粘膜ワクチン研究開発センター 

Web サイトは http://www.ims.u-tokyo.ac.jp/mucovac/index.html です。

 

6.任期 

契約期間は1年毎で、最長2021年3月まで延長可能。

 

7.待遇 

国立大学法人東京大学特定有期雇用教職員の就業に関する規程の定めるところによる。

 

8.応募資格 

  • 博士号を有している、または取得見込であること
  • メタゲノム解析研究に情熱を持って取り組み、他の共同研究者と協力し研究目標達成に向けて努力できる者 

これまでの研究分野は問いませんが、例えば以下のような研究者を念頭に置いております。 

  • スーパーコンピュータを利用した大規模データ解析に興味を持ち、生命科学分野で実験研究者と協力して新たな腸内微生物叢研究を開拓する意欲を持つ研究者
  • 生物情報学、統計学、機械学習など情報解析の技術開発のバックグラウンドを有する研究者
  • 他の分野において実際のデータ解析に従事していて、メタゲノムシークエンス情報解析研究に興味を持っている研究者

 

9.応募締切 

2018年6月15日(金)必着 *決定次第締め切らせていただきます。

 

10.着任時期 

採用決定後できるだけ早い時期。

 

11.提出書類 

(1)履歴書 (http://www.u-tokyo.ac.jp/per01/r01_j.html よりダウンロードの上、記入例3に従って記入のこと)

(2)研究業績リスト (印刷中、投稿中のときはそのことを明記すること)

(3)研究の経緯 (これまでの研究の経緯を 1,000 字程度。単なる事実の羅列ではなく、研究の流れやつながりが分かるように、自己評価も含めた記述にしてくたさい)

(4)論文別刷り2編以内

(5)応募者について問い合わせることのできる方1名の氏名と連絡先

 

12.応募書類の送付先 

電子メールにて suematsu@ims.u-tokyo.ac.jp に 11 の応募書類に相当する情報をお送りください。その際、imoto@ims.u-tokyo.ac.jp にも Cc してください。また、メールのタイトルは「メタゲノム解析特任助教応募」と記載ください。

 

13.照会先 

〒108-8639 東京都港区白金台4−6−1

東京大学医科学研究所国際粘膜ワクチン研究開発センター

植松 智(うえまつ さとし)

電話 03-5449-2162 E-mail: suematsu@ims.u-tokyo.ac.jp

または

東京大学医科学研究所ヘルスインテリジェンスセンター

井元 清哉(いもと せいや)

電話 03-5449-5611 E-mail: imoto@ims.u-tokyo.ac.jp