並列配列相同性検索プログラム「GHOST-MP」講習会

2015年3月20日に東京・お台場の産総研CBRCでHPCI戦略プログラム
・戦略分野1主催の講習会と京互換機(FX10/SCLS計算機システム)
を用いた実習を開催することになりましたので、ご案内申し上げます。

実習は、受講者が各自持参するノートPC から京互換機にリモート
ログインして行いますので、受講者には事前にSSH鍵ペアのご準備
をお願いいたします。またSCLS利用アカウントの申請手続きも別途
必要です。(実習用PCは無線LAN必須、最新のウイルスチェッカー
がインストールされているものをご持参ください。)

「並列配列相同性検索プログラム「GHOST-MP」講習会」

【要旨】
配列相同性検索プログラムGHOST-MPの講習会とSCLS計算機システム
(京互換機)を用いた実習を開催します。
GHOST-MPは、高速な配列相同性検索を行うGHOSTXアルゴリズムを、
分散メモリシステム向けに並列化したソフトウェアです。次世代
シークエンサー等で得られた大量の短い塩基配列またはアミノ酸
配列を入力し、アミノ酸配列データベースに対する相同性検索を
短時間で実行でき、メタゲノム解析などの用途に適します。
講習会では、GHOST-MPのしくみと利用方法を説明し、GHOST-MPを
用いたメタゲノムデータ解析の実習を行います。

【主催】
HPCI戦略プログラム 戦略分野1
「予測する生命科学・医療および創薬基盤」
【共催】
産業技術総合研究所 ゲノム情報研究センター(CBRC)
特定非営利活動法人バイオグリッドセンター関西
公益財団法人都市活力研究所
【後援】
理化学研究所情報基盤センター
バイオスーパーコンピューティング研究会

【日時】
2015年3月20日(金)13:00 ~ 16:30(12:30 より受付開始)

【場所】
産業技術総合研究所・臨海副都心センター
別館8階 コラボレーションコーナー

アクセス http://www.cbrc.jp/ja/map.ja.html

【参加費】 無料

【定員】 10名

申し込み受付開始:2015年1月14日(水)11時より
先着順でお申し込みを受け付けますので、定員になり次第終了します。

【参加申し込み】
次のホームページからお申し込みください。
https://hpci.cbrc.jp/modules/tutorial/F-2.html
申込ボタンは、受講申込受付期間中のみ、表示されます。


受講者には事務局から事前準備についてお知らせしますので、指示に
従ってご準備をお願いいたします。

(注)SCLS利用アカウント申請にあたっては、下記URLにあるSCLS
公募の「応募資格」を満たしていることが条件となります。満たさ
ない方は受講できません。
http://www.scls.riken.jp/supercomputer/public.html


【問い合わせ先】
独立行政法人理化学研究所・HPCI 計算生命科学推進プログラム
scls-mado{at}riken.jp