学会活動

第2回 Bioconductor Carpentries 日本語ワークショップ

2025.08.28

生物学データ分析のオープンソースソフトウェア Bioconductor を用いた RNA-seq

解析方法を、データサイエンスの基本的なスキルを教える目的の非営利団体 

The Carpentriesのスタイルを使って学ぶ、コラボレーションワークショップを開催します。

本ワークショップでは、RNA-seq解析の基礎、R環境への定量データのインポートと

アノテーション処理、DE[G]解析、そしてGene Setエンリッチメント解析まで
を学ぶことを目的としています。皆様のご参加をお待ちしています。


研究会名: 第2回 Bioconductor Carpentries 日本語ワークショップ

日程: 2025年9月11日(木)と12日(金) 10-17時
場所: 京都三大学教養教育研究・推進機構 稲盛記念会館 講義室101
開催方法: 対面およびオンライン

対象: 研究者(大学生、大学院生、教員、等)
参加条件: 管理者権限を持つ Mac/Linux/Windows
OSを搭載したノートパソコン持参。
指定したソフトウェアパッケージを事前にインストールしてください。
詳細はワークショップのホームページをご覧ください。
※本ワークショップで勉強するツール(ソフト)の経験は問いません。

インストラクター: 西田 孝三(理化学研究所)
ヘルパー: 福島 敦史(京都府立大学)

ワークショップのホームページ:
https://bioconductor-translations.github.io/2025-09-11-kyoto/
<https://bioconductor-translations.github.io/2025-09-11-kyoto/>

参加方法:現地参加、オンラインとも、以下から事前申し込み(先着順)
申込URL: https://carpentries.connpass.com/event/365823/


問い合わせ先: 西田(knishida@riken.jp)・福島(afukushima@kpu.ac.jp

The Carpentries とは?
研究用のコンピュータプログラミングとデータサイエンスのスキルを教える、アメリカ発の非営利団体です。
参加型教育を通じて、研究者たちが最新のプログラミングやデータ解析のスキルを互いに教え合う仕組みとして
大学、研究所、科学技術財団から評価され、支援も受けています。
詳しくはホームページをご覧ください:https://carpentries.org/
Software Carpentry (SWC)の日本語サイト: https://swcarpentry-ja.github.io/


このワークショップは 日本バイオインフォマティクス学会(https://www.jsbi.org/
の公募研究会・地域部会(https://www.jsbi.org/activity/koubo/detail--id-898.html)として採択され、ご協力をいただいています。

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