No. | Title | Authors |
P-01 | 抗体医薬品の多要素の最適化にむけたマルチタスク学習手法の開発 | 鬼塚 智大、山口 秀輝、 齋藤 裕 |
P-02 | singleCellHaystack: A clustering-independent method for predicting differentially expressed genes in single cell transcriptome data | Alexis Vandenbon and Diego Diez |
P-03 | プライバシー保護技術を用いた遺伝子発現差異解析 | Kaito Kawaguchi, Yasubumi Sakakibara and Kengo Sato |
P-04 | Boltzmann Machine Learning and Regularization Methods for Inferring Evolutionary Fields and Couplings from a Multiple Sequence Alignment | Sanzo Miyazawa |
P-05 | A Dynamic Molecular Regulatory Network to Determine Hippocampal Cell Fate during Embryogenesis | Zi Wang and Mariko Okada |
P-06 | 遺伝子発現データベースと医療ビッグデータの統合解析を用いた、薬物相互作用に起因するトルバプタンの肝機能異常のメカニズムの探索ならびに実臨床におけるリスク評価 | Takaya Uno, Kouichi Hosomi, Satoshi Yokoyama, Hiromi Takenaka, Megumi Ikura, Ryosuke Oda and Naoki Hayakawa |
P-07 | 核内長鎖非コードRNA ELEANOR2とクロマチンの相互作用解析 | 市川 雄一、斉藤 典子 |
P-08 | シグナル伝達経路における転写因子-標的遺伝子のフィードバックエンリッチメント解析 | 井上 健太郎 |
P-09 | CNNによるPRDM9結合サイト予測の組換えマップを用いた検証 | 中村 峻大、遠藤 俊徳、長田 直樹 |
P-10 | Development of a Quantitative Estimate Index for Early-Stage Screening of Compounds Targeting Protein-Protein Interactions | Takatsugu Kosugi and Masahito Ohue |
P-11 | in silico ドッキングシミュレーション手法を用いた 結核菌polyketide synthase 13に対する新規抗菌薬の探索 | Kahori Murakami, Shunsuke Aoki and Rina Takeda |
P-12 | ChIP-weighted TFEAによる薬剤摂動時の転写因子結合プロファイル | Zhaonan Zou, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi and Shinya Oki |
P-13 | Improvement of learning-to-rank for ligand-based virtual screening using gradient boosting technique with relevance refinement | Kairi Furui and Masahito Ohue |
P-14 | Explainable AI for Gut Microbiome-based Colorectal Cancer Prediction | Ryza Rynazal and Yamada Takuji |
P-15 | Mapping evolutionary distance matrices based on hyperbolic geometry | Hirotaka Matsumoto |
P-16 | 日本人乳癌患者ゲノムデータを用いたhypomorph変異の探索 | 秦 千比呂、中岡 博史 |
P-17 | Protein language models による zero-shot 機能予測および配列探索 | 山口 秀輝、 齋藤 裕 |
P-18 | Application of multiple omics and network projection analyses to drug repositioning for pathogenic mosquito-borne viruses. | Takayuki Amemiya and Kazuhiko Fukui |
P-19 | ターゲットリポジショニング:遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的予測 | Satoko Namba, Michio Iwata and Yoshihiro Yamanishi |
P-20 | Deep learning for the detection of skeletal alterations in 3D biomedical images. | Shun Kawai, Ryo Ihara, Hiroyuki Nakagawa, Kazuki Mikata and Yukio Tominaga |
P-21 | 非線形な時系列に対するガウス過程回帰を用いた因果推論 | 大山 鷹志、遠里 由佳子 |
P-22 | 塩刺激時の線虫神経活動データの時系列解析 | Kentaro Yamamoto, Koki Tsuyuzaki, Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino and Itoshi Nikaido |
P-23 | 炎症性腸疾患を対象にしたマルチオミクスデータ解析 | Keisuke Ota, Hara Akane and Shinji Nakaoka |
P-24 | Hi-Cデータを用いたビニングツールの開発 | Takumi Hattori, Rei Kajitani and Takehiko Itoh |
P-25 | DynCubeProd: Dynamic solution space division-based methods for calculating reaction deletion strategies for constraint-based metabolic networks for substance production | Yier Ma and Takeyuki Tamura |
P-26 | 臨床ビッグデータからの疾患予防薬の探索と治療標的の推定 | Sae Okamoto, Ryusuke Sawada and Yoshihiro Yamanishi |
P-27 | E.coli K-12 MG1655株の機能未知遺伝子群y-omeの特徴解析及びその機能予測可能性の検証 | Hitoshi Iuchi, Michiaki Hamada and Tsukasa Fukunaga |
P-28 | リピート配列由来の機能エレメントの探索 | 曽 超、浜田 道昭 |
P-29 | 遺伝子調節機構解明のための細胞種特異性を考慮した発現変動遺伝子の特徴量抽出 | Gina Oba and Ryuichiro Nakato |
P-30 | 大気マイクロバイオームに基づく空間の自然度予測モデル | Akinobu Toyoda, Koichi Higashi, Hiroshi Mori, Akinori Ikeuchi, Masakazu Ito, Ken Kurokawa and Satoshi Katahira |
P-31 | RCGAToolboxを使った遺伝子回路の自動設計 | Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata |
P-32 | PubMed MeSHターム共起情報を用いたキーワード提示技術のメタボロームデータ解釈への適用 | Fumio Matsuda, Shinji Kanazawa, Yohei Yamada, Satoshi Shimizu, Shigeki Kajihara, Norio Mukai and Junko Iida |
P-33 | 深層学習を用いた電顕画像からのがん組織検出の高精度化及びリアルタイム予測 | Hiroshi Arai, Kenji Etchuya, Chikara Sato and Makiko Suwa |
P-34 | 茨城大学阿見キャンパスにおけるヒヨドリ(Hypsipetes amaurotis)の腸内細菌叢の16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンス解析 | 君和田 勁、成廣 隆、島 綾香、會津 光博、杉浦 奈都子、上塚 浩司 |
P-35 | トランスクリプトームデータを用いたダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物の組み合わせ予測 | Momoko Hamano, Toru Nakamura, Michio Iwata, Ryohei Eguchi and Yoshihiro Yamanishi |
P-36 | On personal identification using splicing junction information | Wataru Nakamura, Masahiro Sugawa, Raul N Mateos, Naoko Iida, Kenichi Chiba, Ai Okada and Yuichi Shiraishi |
P-37 | ヒト組織における転写リードスルーの網羅的解析 | Keisuke Tsujita, Junichi Iwakiri and Kiyoshi Asai |
P-38 | リファレンスゲノムグラフの構築とその応用 | Masaki Hongo, Ayako Tamaki, Hirotsugu Shiroma and Takuji Yamada |
P-39 | 変異クラスに依存しない階層ベイズモデルに基づくがんゲノムのIndelシグネチャー決定 | Taro Matsutani and Michiaki Hamada |
P-40 | 自然言語処理モデルBERTによるタンパク質の天然変性領域の予測 | Ryoga Misu, Akio Kitao and Duy Tran |
P-41 | Trans-AVPGAN: Transformerネットワークを用いた対的生成ネットワークによる抗ウイルスペプチド生成 | Kano Hasegawa, Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada and Kentaro Shimizu |
P-42 | Secondary structure propensities of amino acid N-grams in the Protein Data Bank | Ryohei Kondo, Kota Kasahara and Takuya Takahashi |
P-43 | 腸内細菌叢と成人T細胞白血病の関連性の解析 | Nodoka Chiba, Shingo Nakahata and Takuji Yamada |
P-44 | Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cells | Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki |
P-45 | Drug-Target Affinity Prediction using applicability domain of feature learning | Shunya Sugita and Masahito Ohue |
P-46 | 隠れマルコフモデルを用いたヒト腸内細菌叢の個人内エンテロタイプ遷移の推定 | 横山 源太朗、細田 至温、福永 津嵩、浜田 道昭 |
P-47 | 脳における細胞種特異的なDNA結合モチーフとしての転移因子の機能 | Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada |
P-48 | 液-液相分離の現象に着目したエンハンサーRNAの機能解析 | Arisa Nozaki, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada |
P-49 | ニューロンにおける転移因子の転移異常と統合失調症発症の関係 | Miyako Ishihara, Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada |
P-50 | IS-divergenceを用いた非負値行列因子分解による変異シグネチャ抽出ツールの改善 | Risa Akita, Taro Matsutani and Michiaki Hamada |
P-51 | RNAシュードノット構造を考慮した自由エネルギーランドスケープに関する検討 | Akito Taneda |
P-52 | ヒト遺伝子アノテーションがRNA-seq解析に与える影響の評価 | Yu Hamaguchi, Chao Zeng and Michiaki Hamada |
P-53 | Quantification of RNA-binding Proteins’ effect on target RNA in chronic hypoxia | Xiaoning Sun, Kentaro Kawata, Yoko Ogura, Nobuhito Goda, Koh Nakayama, Yoichiro Wada and Nobuyoshi Akimitsu |
P-54 | 機械学習を用いたタンパク質クリプトサイトの予測法の開発 | Masahito Kumada |
P-55 | 配列空間における適応度地形のトランスロケーションを用いた変異効果予測の精度向上 | 福永 秀蔵 、山口 秀輝、齋藤 裕 |
P-56 | 深層学習を用いたRNAアクセシビリティ予測の高速化 | Kaisei Hara, Natsuki Iwano, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada |
P-57 | セマンティックウェブ技術を用いた微生物糖鎖関連データベース「MicroGlycoDB」の開発 | Miyuki Kikuchi, Kazuhiro Aoki, Christine Szymanski, Yann Guerardel, Louis-David Leclercq, Tamara Doering, Thomas Hurtaux, Kiyotaka Fujita, Takane Katayama, Toshihiko Katoh and Kiyoko Aoki-Kinoshita |
P-58 | 細菌叢データにおける系統樹に基づいた回帰のためのベイジアンモデルの提案 | Shion Hosoda and Michiaki Hamada |
P-59 | The association between epigenetic marks on 3’-untranslated region and transcriptional termination defects in mammals | Takuya Nara, Masaki Shirai, Haruko Takahashi and Yutaka Kikuchi |
P-60 | 転写因子結合部位として働く反復配列の発見とその機能の解明 | Ryo Niwa, Chao Zeng and Michiaki Hamada |
P-61 | ヒト腸内環境メタゲノムデータに対する最適なMAG構築パイプラインの検討 | Ayako Tamaki, Hirotsugu Shiroma, Masaki Hongo, Felix Salim and Takuji Yamada |
P-62 | 塩基対確率に基づくRNA二次構造検索ツールの開発 | Chisato Yuki and Michiaki Hamada |
P-63 | 色付きde Bruijnグラフに基づく索引のハッシュ関数を用いた精度向上とサイズ削減 | Nozomi Hasegawa and Kana Shimizu |
P-64 | LDAを使用した微生物-代謝物相互作用の推定 | Risa Maemura, Shion Hosoda and Michiaki Hamada |
P-65 | Prediction of protein-ligand binding sites using AlphaFold2 and multi-task learning | Shohei Yamaguchi, Haruka Nakashima, Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada and Kentaro Shimizu |
P-66 | Variance Estimation for Conformational Variability Using Random Effect Models | Takashi Amisaki |
P-67 | Development of a repository for glycosylation pathways | Sunmyoung Lee Lee, Kiyoko Aoki-Kinoshita, Tamiko Ono, Isami Sogabe and Masaaki Shiota |
P-68 | A novel fast pipeline for RNA homology search considering secondary structure with E-value calculation | Kento Kubo, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada |
P-69 | 経時一個体RNA-Seqを用いた細胞内及び細胞間制御ネットワーク推定 | Makoto Kashima, Yuki Shida, Takashi Yamashiro, Hiromi Hirata and Hiroshi Kurosaka |
P-70 | ヒト腸内細菌の代謝反応データベースの構築とその応用 | Hirotsugu Shiroma, Youssef Darzi, Etsuko Terajima, Zenichi Nakagawa, Hirotaka Tsuchikura, Yuki Moriya, Shujiro Okuda, Susumu Goto and Takuji Yamada |
P-71 | 異なる生物種間における遺伝子共発現ネットワークの整列 | Takeshi Obayashi, Yuichi Aoki and Kengo Kinoshita |
P-72 | Development of an approach building classification model from the human gut microbiome | Kota Fujisawa, Felix Salim, Hirotsugu Shiroma and Takuji Yamada |
P-73 | 二次構造要素-正規分布モデルを用いた電顕3D密度マップの表現法の開発 | Takeshi Kawabata |
P-74 | 腸内細菌叢は宿主動物の健康状態で変化するか? ― 日立市かみね動物園での検証 ― | 坂場 円香、成廣 隆、飯田 伸弥、生江 信孝、上塚 浩司 |
P-75 | 次元削減手法を用いた画像・遺伝子統合解析によるがん診断基盤の構築 | Yasuhisa Yamamoto, Hisanori Yoshimura, Haruko Takahashi, Daisuke Kawahara and Yutaka Kikuchi |
P-76 | 糖鎖合成経路予測および糖鎖生合成シミュレーションツール「GlycoSim」の新たな機能開発 | Isami Sogabe, Kouiti Arakawa and Kiyoko Aoki-Kinoshita |
P-77 | Prediction of human protein-coding smORFs using k-mer based machine learning | Tatsumi Sato and Tetsushi Yada |
P-78 | ヒト腸内細菌群集構造に基づく疾患共通因子の探索 | Miho Yanagi, Zenichi Nakagawa, Hiroshi Mori, Ken Kurokawa and Takuji Yamada |
P-79 | ベイズ推定を用いた細胞内RNA分解速度の高精度な推定手法の開発 | Kentaro Kawata and Nobuyoshi Akimitsu |
P-80 | 胚発生における遺伝子発現制御モデルの時空間的妥当性を評価する数理モデルの構築 | Yukitaka Isaka, Nen Saito and Chikara Furusawa |
P-81 | 敵対的生成ネットワークを用いた転写因子結合配列の生成 | Yukai Takagi, Haruka Ozaki, Kotaro Sakamoto and Akihiro Kuno |
P-82 | Detecting “hybrid transposable elements” formed by homologous recombination | Huan Zhang |
P-83 | ヒトのエンハンサーと遺伝子相互作用や転写制御に影響する、方向性のある転写因子DNA結合配列の発見 | 大里 直樹、浜田 道昭 |
P-84 | MSDC-MD Simulation for Free-energy analysis of Calmodulin | Hiromitsu Shimoyama and Yasuteru Shigeta |
P-85 | 並進回転同変なニューラルネットワークを用いた蛋白質間相互作用部位予測についての検討 | Tsukasa Nakamura |
P-86 | BioRuby 2.0とそのメンテナンスについて | Naohisa Goto |