ポスター発表

No.TitleAuthors
P-01抗体医薬品の多要素の最適化にむけたマルチタスク学習手法の開発鬼塚 智大、山口 秀輝、 齋藤 裕
P-02singleCellHaystack: A clustering-independent method for predicting differentially expressed genes in single cell transcriptome dataAlexis Vandenbon and Diego Diez
P-03プライバシー保護技術を用いた遺伝子発現差異解析Kaito Kawaguchi, Yasubumi Sakakibara and Kengo Sato
P-04Boltzmann Machine Learning and Regularization Methods for Inferring Evolutionary Fields and Couplings from a Multiple Sequence AlignmentSanzo Miyazawa
P-05A Dynamic Molecular Regulatory Network to Determine Hippocampal Cell Fate during EmbryogenesisZi Wang and Mariko Okada
P-06遺伝子発現データベースと医療ビッグデータの統合解析を用いた、薬物相互作用に起因するトルバプタンの肝機能異常のメカニズムの探索ならびに実臨床におけるリスク評価Takaya Uno, Kouichi Hosomi, Satoshi Yokoyama, Hiromi Takenaka, Megumi Ikura, Ryosuke Oda and Naoki Hayakawa
P-07核内長鎖非コードRNA ELEANOR2とクロマチンの相互作用解析市川 雄一、斉藤 典子
P-08シグナル伝達経路における転写因子-標的遺伝子のフィードバックエンリッチメント解析井上 健太郎
P-09CNNによるPRDM9結合サイト予測の組換えマップを用いた検証中村 峻大、遠藤 俊徳、長田 直樹
P-10Development of a Quantitative Estimate Index for Early-Stage Screening of Compounds Targeting Protein-Protein InteractionsTakatsugu Kosugi and Masahito Ohue
P-11in silico ドッキングシミュレーション手法を用いた 結核菌polyketide synthase 13に対する新規抗菌薬の探索Kahori Murakami, Shunsuke Aoki and Rina Takeda
P-12ChIP-weighted TFEAによる薬剤摂動時の転写因子結合プロファイルZhaonan Zou, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi and Shinya Oki
P-13Improvement of learning-to-rank for ligand-based virtual screening using gradient boosting technique with relevance refinementKairi Furui and Masahito Ohue
P-14Explainable AI for Gut Microbiome-based Colorectal Cancer PredictionRyza Rynazal and Yamada Takuji
P-15Mapping evolutionary distance matrices based on hyperbolic geometryHirotaka Matsumoto
P-16日本人乳癌患者ゲノムデータを用いたhypomorph変異の探索秦 千比呂、中岡 博史
P-17Protein language models による zero-shot 機能予測および配列探索山口 秀輝、 齋藤 裕
P-18Application of multiple omics and network projection analyses to drug repositioning for pathogenic mosquito-borne viruses.Takayuki Amemiya and Kazuhiko Fukui
P-19ターゲットリポジショニング:遺伝子摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的予測Satoko Namba, Michio Iwata and Yoshihiro Yamanishi
P-20Deep learning for the detection of skeletal alterations in 3D biomedical images.Shun Kawai, Ryo Ihara, Hiroyuki Nakagawa, Kazuki Mikata and Yukio Tominaga
P-21非線形な時系列に対するガウス過程回帰を用いた因果推論大山 鷹志、遠里 由佳子
P-22塩刺激時の線虫神経活動データの時系列解析Kentaro Yamamoto, Koki Tsuyuzaki, Yu Toyoshima, Hirofumi Sato, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino and Itoshi Nikaido
P-23炎症性腸疾患を対象にしたマルチオミクスデータ解析Keisuke Ota, Hara Akane and Shinji Nakaoka
P-24Hi-Cデータを用いたビニングツールの開発Takumi Hattori, Rei Kajitani and Takehiko Itoh
P-25DynCubeProd: Dynamic solution space division-based methods for calculating reaction deletion strategies for constraint-based metabolic networks for substance productionYier Ma and Takeyuki Tamura
P-26臨床ビッグデータからの疾患予防薬の探索と治療標的の推定Sae Okamoto, Ryusuke Sawada and Yoshihiro Yamanishi
P-27E.coli K-12 MG1655株の機能未知遺伝子群y-omeの特徴解析及びその機能予測可能性の検証Hitoshi Iuchi, Michiaki Hamada and Tsukasa Fukunaga
P-28リピート配列由来の機能エレメントの探索曽 超、浜田 道昭
P-29遺伝子調節機構解明のための細胞種特異性を考慮した発現変動遺伝子の特徴量抽出Gina Oba and Ryuichiro Nakato
P-30大気マイクロバイオームに基づく空間の自然度予測モデルAkinobu Toyoda, Koichi Higashi, Hiroshi Mori, Akinori Ikeuchi, Masakazu Ito, Ken Kurokawa and Satoshi Katahira
P-31RCGAToolboxを使った遺伝子回路の自動設計Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata
P-32PubMed MeSHターム共起情報を用いたキーワード提示技術のメタボロームデータ解釈への適用Fumio Matsuda, Shinji Kanazawa, Yohei Yamada, Satoshi Shimizu, Shigeki Kajihara, Norio Mukai and Junko Iida
P-33深層学習を用いた電顕画像からのがん組織検出の高精度化及びリアルタイム予測Hiroshi Arai, Kenji Etchuya, Chikara Sato and Makiko Suwa
P-34茨城大学阿見キャンパスにおけるヒヨドリ(Hypsipetes amaurotis)の腸内細菌叢の16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンス解析君和田 勁、成廣 隆、島 綾香、會津 光博、杉浦 奈都子、上塚 浩司
P-35トランスクリプトームデータを用いたダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物の組み合わせ予測Momoko Hamano, Toru Nakamura, Michio Iwata, Ryohei Eguchi and Yoshihiro Yamanishi
P-36On personal identification using splicing junction informationWataru Nakamura, Masahiro Sugawa, Raul N Mateos, Naoko Iida, Kenichi Chiba, Ai Okada and Yuichi Shiraishi
P-37ヒト組織における転写リードスルーの網羅的解析Keisuke Tsujita, Junichi Iwakiri and Kiyoshi Asai
P-38リファレンスゲノムグラフの構築とその応用Masaki Hongo, Ayako Tamaki, Hirotsugu Shiroma and Takuji Yamada
P-39変異クラスに依存しない階層ベイズモデルに基づくがんゲノムのIndelシグネチャー決定Taro Matsutani and Michiaki Hamada
P-40自然言語処理モデルBERTによるタンパク質の天然変性領域の予測Ryoga Misu, Akio Kitao and Duy Tran
P-41Trans-AVPGAN: Transformerネットワークを用いた対的生成ネットワークによる抗ウイルスペプチド生成Kano Hasegawa, Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada and Kentaro Shimizu
P-42Secondary structure propensities of amino acid N-grams in the Protein Data BankRyohei Kondo, Kota Kasahara and Takuya Takahashi
P-43腸内細菌叢と成人T細胞白血病の関連性の解析Nodoka Chiba, Shingo Nakahata and Takuji Yamada
P-44Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cellsTakaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
P-45Drug-Target Affinity Prediction using applicability domain of feature learningShunya Sugita and Masahito Ohue
P-46隠れマルコフモデルを用いたヒト腸内細菌叢の個人内エンテロタイプ遷移の推定横山 源太朗、細田 至温、福永 津嵩、浜田 道昭
P-47脳における細胞種特異的なDNA結合モチーフとしての転移因子の機能Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada
P-48液-液相分離の現象に着目したエンハンサーRNAの機能解析Arisa Nozaki, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada
P-49ニューロンにおける転移因子の転移異常と統合失調症発症の関係Miyako Ishihara, Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada
P-50IS-divergenceを用いた非負値行列因子分解による変異シグネチャ抽出ツールの改善Risa Akita, Taro Matsutani and Michiaki Hamada
P-51RNAシュードノット構造を考慮した自由エネルギーランドスケープに関する検討Akito Taneda
P-52ヒト遺伝子アノテーションがRNA-seq解析に与える影響の評価Yu Hamaguchi, Chao Zeng and Michiaki Hamada
P-53Quantification of RNA-binding Proteins’ effect on target RNA in chronic hypoxiaXiaoning Sun, Kentaro Kawata, Yoko Ogura, Nobuhito Goda, Koh Nakayama, Yoichiro Wada and Nobuyoshi Akimitsu
P-54機械学習を用いたタンパク質クリプトサイトの予測法の開発Masahito Kumada
P-55配列空間における適応度地形のトランスロケーションを用いた変異効果予測の精度向上福永 秀蔵 、山口 秀輝、齋藤 裕
P-56深層学習を用いたRNAアクセシビリティ予測の高速化Kaisei Hara, Natsuki Iwano, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada
P-57セマンティックウェブ技術を用いた微生物糖鎖関連データベース「MicroGlycoDB」の開発Miyuki Kikuchi, Kazuhiro Aoki, Christine Szymanski, Yann Guerardel, Louis-David Leclercq, Tamara Doering, Thomas Hurtaux, Kiyotaka Fujita, Takane Katayama, Toshihiko Katoh and Kiyoko Aoki-Kinoshita
P-58細菌叢データにおける系統樹に基づいた回帰のためのベイジアンモデルの提案Shion Hosoda and Michiaki Hamada
P-59The association between epigenetic marks on 3’-untranslated region and transcriptional termination defects in mammalsTakuya Nara, Masaki Shirai, Haruko Takahashi and Yutaka Kikuchi
P-60転写因子結合部位として働く反復配列の発見とその機能の解明Ryo Niwa, Chao Zeng and Michiaki Hamada
P-61ヒト腸内環境メタゲノムデータに対する最適なMAG構築パイプラインの検討Ayako Tamaki, Hirotsugu Shiroma, Masaki Hongo, Felix Salim and Takuji Yamada
P-62塩基対確率に基づくRNA二次構造検索ツールの開発Chisato Yuki and Michiaki Hamada
P-63色付きde Bruijnグラフに基づく索引のハッシュ関数を用いた精度向上とサイズ削減Nozomi Hasegawa and Kana Shimizu
P-64LDAを使用した微生物-代謝物相互作用の推定Risa Maemura, Shion Hosoda and Michiaki Hamada
P-65Prediction of protein-ligand binding sites using AlphaFold2 and multi-task learningShohei Yamaguchi, Haruka Nakashima, Yoshitaka Moriwaki, Tohru Terada and Kentaro Shimizu
P-66Variance Estimation for Conformational Variability Using Random Effect ModelsTakashi Amisaki
P-67Development of a repository for glycosylation pathwaysSunmyoung Lee Lee, Kiyoko Aoki-Kinoshita, Tamiko Ono, Isami Sogabe and Masaaki Shiota
P-68A novel fast pipeline for RNA homology search considering secondary structure with E-value calculationKento Kubo, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada
P-69経時一個体RNA-Seqを用いた細胞内及び細胞間制御ネットワーク推定Makoto Kashima, Yuki Shida, Takashi Yamashiro, Hiromi Hirata and Hiroshi Kurosaka
P-70ヒト腸内細菌の代謝反応データベースの構築とその応用Hirotsugu Shiroma, Youssef Darzi, Etsuko Terajima, Zenichi Nakagawa, Hirotaka Tsuchikura, Yuki Moriya, Shujiro Okuda, Susumu Goto and Takuji Yamada
P-71異なる生物種間における遺伝子共発現ネットワークの整列Takeshi Obayashi, Yuichi Aoki and Kengo Kinoshita
P-72Development of an approach building classification model from the human gut microbiomeKota Fujisawa, Felix Salim, Hirotsugu Shiroma and Takuji Yamada
P-73二次構造要素-正規分布モデルを用いた電顕3D密度マップの表現法の開発Takeshi Kawabata
P-74腸内細菌叢は宿主動物の健康状態で変化するか? ― 日立市かみね動物園での検証 ―坂場 円香、成廣 隆、飯田 伸弥、生江 信孝、上塚 浩司
P-75次元削減手法を用いた画像・遺伝子統合解析によるがん診断基盤の構築Yasuhisa Yamamoto, Hisanori Yoshimura, Haruko Takahashi, Daisuke Kawahara and Yutaka Kikuchi
P-76糖鎖合成経路予測および糖鎖生合成シミュレーションツール「GlycoSim」の新たな機能開発Isami Sogabe, Kouiti Arakawa and Kiyoko Aoki-Kinoshita
P-77Prediction of human protein-coding smORFs using k-mer based machine learningTatsumi Sato and Tetsushi Yada
P-78ヒト腸内細菌群集構造に基づく疾患共通因子の探索Miho Yanagi, Zenichi Nakagawa, Hiroshi Mori, Ken Kurokawa and Takuji Yamada
P-79ベイズ推定を用いた細胞内RNA分解速度の高精度な推定手法の開発Kentaro Kawata and Nobuyoshi Akimitsu
P-80胚発生における遺伝子発現制御モデルの時空間的妥当性を評価する数理モデルの構築Yukitaka Isaka, Nen Saito and Chikara Furusawa
P-81敵対的生成ネットワークを用いた転写因子結合配列の生成Yukai Takagi, Haruka Ozaki, Kotaro Sakamoto and Akihiro Kuno
P-82Detecting “hybrid transposable elements” formed by homologous recombinationHuan Zhang
P-83ヒトのエンハンサーと遺伝子相互作用や転写制御に影響する、方向性のある転写因子DNA結合配列の発見大里 直樹、浜田 道昭
P-84MSDC-MD Simulation for Free-energy analysis of CalmodulinHiromitsu Shimoyama and Yasuteru Shigeta
P-85並進回転同変なニューラルネットワークを用いた蛋白質間相互作用部位予測についての検討Tsukasa Nakamura
P-86BioRuby 2.0とそのメンテナンスについてNaohisa Goto