ポスター発表演題

P-01      代謝系の動的特性解析のための速度モデルにおける大過剰化合物の有無の影響

Daisuke Tominaga, Hideo Kawaguchi, Yoshimi Hori, Tomohisa Hasunuma and Chiaki Ogino

 

P-02      ゲノム・コホート研究における疫学者とバイオインフォマティシャンの共同研究の現状と課題

須藤洋一, 八谷剛史, 小巻翔平, 大桃秀樹, 清水厚志

 

P-03      テンソル分解を用いた教師無し学習による変数選択法のバイオインフォマティクスへの応用

Y-H. Taguchi

 

P-04      人工知能を使って乳がん患者の生存予後を正確に予測する

Hideyuki Shimizu and Keiichi Nakayama

 

P-05      Global sensitivity analysis in signaling pathway model

Kentaro Inoue

 

P-06      Large-scale phylogenetic analysis of polynucleotide kinase Clp1 and characterization of a novel bacterial Clp1

Motofumi Saito, Asako Sato, Shohei Nagata, Masaru Tomita, Satoshi Tamaki, Haruo Suzuki and Akio Kanai

 

P-07      Cyclic attractor estimation in Boolean networks

Ulrike Münzner, Edda Klipp, Marcus Krantz and Tatsuya Akutsu

 

P-08      Prediction efficacy of neuroblastoma risk by DNA methylation data

Ryuichi Sugino, Sayaka Mansai, Miki Ohira and Takehiko Kamijo

 

P-09      相互作用パターン抽出による生物種ワイドな相互作用予測法の開発

白石慧, 奥田利美, 宮坂奈津子, 大杉知裕, 佐竹炎

 

P-10      ヒト大腸がん由来オルガノイドの深層学習による形態分類

津久井隆裕, 辛剣徳, 夏目康子, 長山聡, 八尾良司, 津田宏治

 

P-11      iMETHYLデータを用いたマルチオミクス解析

Shohei Komaki, Yuh Shiwa, Ryohei Furukawa, Tsuyoshi Hachiya, Hideki Ohmomo, Yoichi Sutoh, Ryo Otomo, Makoto Sasaki and Atsushi Shimizu

 

P-12      A New Method for Transforming Pseudo-knotted RNA Secondary Structures into Trees

Feiqi Wang and Tatsuya Akutsu

 

P-13      Pan-cancer module network analysis for identifying dominating networks across human cancers

Chun-Yu Lin, Jinn-Moon Yang and Tatsuya Akutsu

 

P-14      DNAメチル化解析における次世代シークエンスプラットフォームの検討

Hideki Ohmomo, Natsuko O.Shinozaki, Shohei Komaki, Ryo Otomo, Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Makoto Sasaki and Atsushi Shimizu

 

P-15      トゲクマムシEchiniscus testudoにおける乾眠機構解明に向けたマルチオミクス解析

Yumi Murai, Masayuki Fujiwara, Masaru Tomita and Kazuharu Arakawa

 

P-16      代謝ネットワーク再構築による海洋微生物群集の共生関係解析

島田剛志, 浜田道昭

 

P-17      eCLIPデータを用いたRNA結合タンパク質と転移因子の結合特異性解析

松丸綾子, 浜田道昭

 

P-18      Comparison of isoforms between transcripts of FANTOM CAT and transcripts sequenced by MinION

Shion Ishikawa, Hiromi Hiromi Nishiyori-Sueki, Shohei Noma, Michihira Tagami, Akira Hasegawa, Shuhei Noguchi, Takeya Kasukawa, Miki Kojima-Ishiyama, Mitsuyoshi Murata, Masayoshi Itoh, Piero Carninci and Martin Frith

 

P-19      Toward detecting structural variations in human genome using graph structures

Harazono Yoritaka and Masahiro Kasahara

 

P-20      Coupled HMMを用いたクロマチン状態の推定と機能解析

木場研吾, 浜田道昭

 

P-21      米ぬか摂取による大腸炎抑制機構の解明

Kazuki Tanaka, Wanping Aw, Kenta Suzuki, Masaru Tomita and Shinji Fukuda

 

P-22      トランスクリプトーム解析による川崎病に関与する長鎖ノンコーディングRNAの探索および機能解析

Shotaro Hayakawa, Mako Okabe, Keiichi Hirono and Michiaki Hamada

 

P-23      代表タンパク質構造群とのアラインメントを用いた高速なタンパク質間相互作用予測

Takanori Hayashi, Masahito Ohue and Yutaka Akiyama

 

P-24      バクテリアの有するグループIIイントロンの大規模系統解析

Masahiro Miura, Shohei Nagata, Satoshi Tamaki, Masaru Tomita and Akio Kanai

 

P-25      ショットガンメタゲノムシークエンスを用いた病原微生物診断法の開発

堀場千尋, 鳥居ゆか, 嶋田繭子, 鈴木高子, 武内俊, 奥村俊彦, 川田潤一, 高橋義行, 荻朋男, 伊藤嘉規

 

P-26      TimeXNet Web: Identifying cellular response networks from diverse time-course omics profiles

Phit Ling Tan, Yosvany López, Kenta Nakai and Ashwini Patil

 

P-27      秘密分散を用いた安全な編集距離計算

深見匠, 浜田道昭

 

P-28      A non-negative matrix factorization based method for discovering novel differentially expressed genes from single-cell RNA-seq

Hirotaka Matsumoto, Tetsutaro Hayashi, Haruka Ozaki, Koki Tsuyuzaki and Itoshi Nikaido

 

P-29      ネガティブフィードバック構造に基づく生物振動子の頑健性と調節可能性の解析

Kazuhiro Maeda and Hiroyuki Kurata

 

P-30      MoMIG: グラフゲノムブラウザ

Toshiyuki Yokoyama, Yoshitaka Sakamoto, Masahide Seki, Yutaka Suzuki and Masahiro Kasahara

 

P-31      Three-Dimensional Chromatin Structures Coordinate with Gene Expression Levels and Reveals Inter-chromosomal Interactions in B-Cell Lymphoma

Luis A. E. Nagai, Sung-Joon Park and Kenta Nakai

 

P-32      OpenLooper: A web-based platform for managing multi-layered NGS data

Sung-Joon Park and Kenta Nakai

 

P-33      3次元畳み込みニューラルネットワークを用いたタンパク質予測立体構造の評価手法の開発

Rin Sato and Takashi Ishida

 

P-34      稀な遺伝病を引き起こす GLA 遺伝子の変異と疾患との関係

Seiji Saito

 

P-36      膜タンパク質電子顕微鏡画像と立体構造の二次元的照合技術の開発

竜二 篠崎, 修己 池田 and 牧子 諏訪

 

P-37      脂肪由来幹細胞（Adipose-derived stem cell）の分化に関与するエピジェネティック因子の探索

山谷恭代, 朴聖俊, 中井謙太

 

P-38      Improvement of prediction accuracy by metabolic model using experimental data to improve microbial production of valuable chemicals

Yuki Kuriya, Akira Ohyama, Tomokazu Shirai and Michihiro Araki

 

P-39      Detection of transposable elements in long DNA reads

Jiayi Yao, Martin Frith and Satomi Mitsuhashi

 

P-40      一時的社会寄生種であるトゲアリ（Polyrhachis lamellidens）が行う馬乗り行動の分子基盤の解明

岩井碩慶, 河野暢明, 冨田勝, 堀川大樹, 荒川和晴

 

P-41      希少糖摂取による腸内細菌叢変化は抗肥満効果をもたらす

Nao Takeuchi, Kazuki Tanaka, Wanping Aw, Masaru Tomita and Shinji Fukuda

 

P-42      Evolutionary analysis of reverse transcriptases-related proteins and their diversities in prokaryotes

Shohei Nagata, Masaru Tomita and Akio Kanai

 

P-43      薬物応答性の個人差をタンパク質立体構造情報から探る

Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu and Tsuyoshi Shirai

 

P-44      MicroRNA-mediated regulation of midgut regeneration in Drosophila

Masahiko Takemura and Hiroshi Nakato

 

P-45      公共データベースの顕微鏡画像を用いた細胞核分裂の定量計測と表現型解析

遠里由佳子, 岡田初美, 京田耕司, 大浪修一

 

P-46      Comparative analysis of gene co-expression networks of Glioblastoma

Natsu Nakajima, Tomoatsu Hayashi, Katsunori Fujiki, Tetsu Akiyama, Katsuhiko Shirahige and Ryuichiro Nakato

 

P-47      Body-wide Tissue Analysis to Identify Differential and Core Epithelial Transcriptome

Ying Chen and Wataru Fujibuchi

 

P-48      Millefy: Genome browser-like visualization for single cell RNA-seq data sets

Haruka Ozaki, Testutaro Hayashi and Itoshi Nikaido

 

P-49      Mixed Realityを用いた蛋白質・リガンドの三次元可視化による創薬支援システムの開発

小山敦史, 安尾信明, 関嶋政和

 

P-50      一括学習型自己組織化マップ（BLSOM）による南極微生物からの水平伝播候補遺伝子検出

Yu Akazawa, Takashi Abe and Tomoya Baba

 

P-51      Construction of membrane permeability prediction system for cyclic peptides using enhanced sampling molecular dynamics simulation

Yicong Huang, Yasushi Yoshikawa, Naoki Wakui, Masahito Ohue and Yutaka Akiyama

 

P-52      Extraction Transformation Load (ETL) アプローチに基づくがんゲノム解析パイプラインの開発

Kenichi Chiba, Ai Okada, Hiromu Ochiai and Yuichi Shiraishi

 

P-53      jMorp: Japanese Multi Omics Reference Panel

Shu Tadaka, Daisuke Saigusa, Ikuko Motoike, Jin Inoue, Yuichi Aoki, Matsuyuki Shirota, Masao Ueki, Satoshi Makino, Chinatsu Gocho, Kaname Kojima, Yuki Kagaya, Seizo Koshiba, Fumiki Katsuoka, Gen Tamiya, Atsushi Shimizu, Masayuki Yamamoto and Kengo Kinoshita

 

P-54      クモヒメバチによる造網行動操作の分子機構探索：クモとハチ両方向からのトランスクリプトーム解析

髙須賀圭三, 河野暢明, 冨田勝, 荒川和晴

 

P-55      ハイスループット変異検出に向けた手法の検討

増田貴宏, 河野暢明, 冨田勝, 荒川和晴

 

P-56      Spatiotemporal reconstruction of gene expression during embryogenesis combining RNA seq and cell movement imaging

Yasuhiro Kojima and Hisanori Kiryu

 

P-57      転写因子を介したディジーゾーム解析による疾患間の関連性理解と創薬応用

Michio Iwata, Shinya Oki, Yasuo Tabei and Yoshihiro Yamanishi

 

P-58      タンパク質ポケット構造情報を考慮した機械学習によるリガンド結合予測

Toshitaka Tanebe and Takashi Ishida

 

P-59      肝臓特異的Hhex 欠失マウス肝臓における嚢胞発生と網羅的発現情報を用いた遺伝子ネットワークモデル

Tomokazu Fukuchi, Taichi Yamamoto, Tamio Noguchi and Nobuyoshi Shiojiri

 

P-60      Graph Splitting Method Resolves the Early Evolution of Protein Superfamilies

Motomu Matsui and Wataru Iwasaki

 

P-61      Comparison of accuracy of genomic prediction models based on genome-wide or 12 yield-related gene SNPs

Hiromi Kajiya-Kanegae, Kiyosumi Hori, Tomomori Kataoka, Junichi Tanaka and Hiroyoshi Iwata

 

P-62      Frameshift mutations can be canceled out via frameshift suppression in wild-type bacteria

Ken Kuroki, Ching-Chia Yang and Wataru Iwasaki

 

P-63      EpiDWM: incorporating epigenomic information in dinucleotide weight matrix reveals tissue-specific transcription factor binding sites

Fei-Man Hsu and Paul Horton

 

P-64      Inferring gene regulatory network and differentiation dynamics of human embryonic stem cell

Yukitaka Isaka, Nen Saito, Chikara Furusawa, Yuhki Nakatake, Shigeru B.H. Ko, Norio Goda, Shunichi Wakabayashi, Hidenori Akutsu, Ryo Matoba and Minoru S.H. Ko

 

P-65      原核生物RNA結合タンパク質Hfqにおける真核生物への異種発現

Minoru Nakai and Josephine Galipon

 

P-66      大腸菌ミューテーター株を用いたマウス腸内環境における適応変異解析

月見友哉, 重盛駿, 荒川和晴, 増田貴宏, 宮内栄治, 中東憲治, 冨田勝, 大野博司, 森浩禎, 福田真嗣

 

P-67      遺伝子モジュールに基づく細胞間類似度算出法の開発

Yuji Kozakura and Wataru Fujibuchi

 

P-68      医療情報の安全な統合分析を可能にする秘密計算

Ibuki Mishina, Dai Ikarashi, Koki Hamada and Ryo Kikuchi

 

P-69      ETL・ExTLフレームワークを利用したクラウド上での解析エンジンの実装

Hiromu Ochiai, Kenichi Chiba, Ai Okada and Yuichi Shiraishi

 

P-70      BS-Seeker3: Ultrafast pipeline for bisulfite sequencing

Paoyang Chen

 

P-71      Prediction of HIV-1 fusion inhibitor resistance by machine learning

Keisuke Yoshimura and Takanori Sasaki

 

P-72      Performance Improvements of PPI Prediction Software by Tuning GPU Device Allocation on Multi-GPU Environments

Kento Aoyama, Masahito Ohue and Yutaka Akiyama

 

P-73      DNAヒドロキシメチル化とヒストンH4K8アセチル化によるヒト多能性幹細胞遺伝子発現変動

石川靖久, 朴聖俊, 中井謙太

 

P-74      Effective time scale and optimal sampling interval for protein-ligand interaction

Masanori Yamanaka

 

P-75      Clustering of differentially expressed genes of non-small-cell lung cancer and correlation between those clusters

Kohei Misu, Masahiro Sugimoto and Takanori Sasaki

 

P-76      大域的化合物特徴を表現するグラフ畳込みニューラルネットワーク

伊井良太, 柳澤渓甫, 大上雅史, 秋山泰

 

P-77      木構造棒折り過程によるIRMの階層化と生命情報解析への応用

宮原雅人, 浜田道昭

 

P-78      Nanoporeを用いたde novoアセンブルにおけるリード長とデータ量の最適化

Akino Shiroma, Nana Arakaki, Mayumi Kawamitsu and Manabu Fujie

 

P-79      ランク学習を用いたリード最適化経路予測手法の開発

Nobuaki Yasuo, Keisuke Watanabe, Naoki Arai, Hideto Hara, Kentaro Rikimaru and Masakazu Sekijima

 

P-80      機械学習を利用したMRI画像によるグリオーマ患者のゲノム・エピゲノム情報予測

河口理紗, 高橋雅道, 三宅基隆, 木下学, 市村幸一, 浜本隆二, 成田善孝, 瀬々潤

 

P-81      Accurate detection of somatic mutations by leveraging tumor phylogenetic tree information

Takuya Moriyama, Seiya Imoto and Rui Yamaguchi

 

P-82      比較ゲノム解析によるMicrococcaceae科に
おける紫外線耐性関連遺伝子群の探索

Kounosuke Ii, Yuki Yoshida, Nobuaki Kono, Ivan Glaucio Paulino Lima, Masaru Tomita, Lynn Justine Rothschild and Kazuharu Arakawa

 

P-83      Maintenance of BioRuby open-source bioinformatics toolkit

Naohisa Goto

 

P-84      minialign: PacBio・Nanoporeロングリード向けアライメントツール

鈴木創, 笠原雅弘

 

P-85      InexactなSeedを使ったInterspersed Repeatの検出

Daisuke Nonaka and Tsukasa Fukunaga

 

P-86      Evolutionary analysis of a putative RNA-regulating protein PF1614 in Pyrococcus furiosus

Ayano Sakai, Motofumi Saito, Asako Sato, Masaru Tomita, Satoshi Tamaki and Akio Kanai

 

P-87      Inference of Metabolite-mediated Microbiome’s Effect on the Host Phenotype

Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi and Kengo Kinoshita

 

P-88      Data assimilation for systems biology based on second-order adjoint techniques

Yutaro Konta and Hisanori Kiryu

 

P-89      個人ゲノム情報に基づくヒト顔形状の予測をめざして

今西規, 中川草, 木村亮介, 瀧靖之, 安藤寿康

 

P-90      SIMPLE: Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra

Dai Hai Nguyen, Canh Hao Nguyen and Hiroshi Mamitsuka

 

P-91      細菌群及び遺伝子群に基づいたヒト腸内細菌叢解析

細田至温, 西嶋傑, 福永津嵩, 服部正平, 道昭 浜田

 

P-92      Computational methods for design of metabolic networks for production of valuable compounds

Takeyuki Tamura

 

P-93      Octave/Matlab上での生化学反応のbrute force生成の試み－4本の結合が切断される場合について

大槻和平, 太田潤

 

P-94      遺伝子発現データと転移学習を用いた畳み込みニューラルネットワークによる小規模データセットのための毒性予測システム

Hiroki Takahashi, Junko Yamane and Wataru Fujibuchi

 

P-95      発現相関遺伝子群による遺伝子の影響範囲推定法の開発

Tatsuya Sakaguchi and Yuichiro Higasimoto

 

P-96      VPYLMを用いた、がんゲノム突然変異の文脈探索

松谷太郎, 浜田道昭