受賞者一覧

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後藤修賞（最優秀発表賞）

🥇 後藤修(最優秀口頭発表)賞

O6-3 一般口頭発表

受賞者 川口凪咲

DT-Patricia: パトリシア木の対角遷移アルゴリズムの統合による高速・厳密な大規模大域類似検索

DT-Patricia: Fast and Exact Global Similarity Search over Large-Scale Sequence Sets Using the Diagonal Transition Algorithm on a Patricia Tree

川口 凪咲 ¹

1. 東京大学大学院新領域創成科学研究科

🥇 後藤修(最優秀ハイライトトラック)賞

O2-3 ハイライトトラック

受賞者 宮地佑奈

階層型Transformerベースの深層学習モデルSpliceSelectNetによるスプライス部位予測

SpliceSelectNet: A Hierarchical Transformer-Based Deep Learning Model for Splice Site Prediction

宮地 佑奈 ¹ 、 中井 謙太 ^1,2

1. 東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻 2. 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター

🥇 後藤修(最優秀ポスター発表)賞

P2-52 ポスター発表

受賞者 佐藤茉奈

構造予測を用いた指向性進化によるペプチドナノポアの人工設計

Artificial peptide nanopore design by directed evolution using structure prediction

佐藤 茉奈 ¹ 、 藤田 祥子 ¹ 、 川野 竜司 ¹

1. 東京農工大学　工学府　生命工学専攻

🥈

優秀発表賞

🥈 優秀口頭発表賞

O5-1 一般口頭発表

受賞者 野村亮輔

がん周囲の細胞・遺伝子分布の空間的均一性に基づくSpatialCompassV（SCOMV）によるがん領域分類

SpatialCompassV (SCOMV) classifies tumor regions based on the spatial uniformity of peritumoral cells and genes

野村 亮輔 ^1,2 、 酒井 俊輔 ¹ 、 影山 俊一郎 ¹ 、 土原 一哉 ^1,3,4 、 山下 理宇 ^1,2,4

1. 国立がん研究センター　先端医療開発センター 2. 東京大学大学院　新領域創成科学研究科　メディカル情報生命専攻 3. 東京大学大学院　新領域創成科学研究科　先端生命科学専攻 4. 東京理科大学 生命科学研究科 生命科学専攻

O8-3 一般口頭発表

受賞者 坂口達也

酵母インタラクトームのハイスループットマッピングにより明らかとなったタンパク質相互作用QTLのトランス制御の優位性

The Trans-Regulatory Dominance of Protein-Interaction QTLs Uncovered by High-Throughput Mapping of the Yeast Interactome

坂口 達也 ¹ 、 Besse Savandara ² 、 Serohijos Adrian ³

1. 長崎大学大学院医歯薬学総合研究科（薬学系）機能性分子化学分野 2. パリ・シテ大学 機能適応生物学ユニット 3. モントリール大学 生物化学部門

🥈 優秀ハイライトトラック賞

O6-1 ハイライトトラック

受賞者 秋山真那斗

オルソログ情報と生成モデルを活用した異種間遺伝子設計

Cross-species gene redesign leveraging ortholog information and generative modeling

秋山 真那斗 ¹ 、 田代 元彦 ² 、 黄 穎 ² 、 上原 美夏 ¹ 、 神崎 泰輝 ³ 、 板谷 光泰 ³ 、 片岡 正和 ³ 、 宮本 憲二 ² 、 榊原 康文 ^1,2

1. 北里大学 2. 慶應義塾大学 3. 信州大学

O7-4 ハイライトトラック

受賞者 Alexis Vandenbon

DeepSpaceDB 2.0: an interactive spatial transcriptomics database for large-scale Xenium data exploration

DeepSpaceDB 2.0: an interactive spatial transcriptomics database for large-scale Xenium data exploration

Vladyslav Honcharuk ¹ 、 Keiko Takemoto ¹ 、 Diego Diez ² 、 Shinpei Kawaoka ^1,3 、 Alexis Vandenbon ¹

1. 京都大学 2. 大阪大学 3. 東北大学

🥈 優秀ポスター発表賞

P1-26 ポスター発表

受賞者 大野聡

深層学習に基づく代謝フラックス推定

Deep learning-based single-cell metabolic flux inference

大野 聡 ¹

1. 筑波大学生存ダイナミクス研究センター

P2-37 ポスター発表

受賞者 川崎純菜

ウイルスゲノム配列・疫学情報・感染応答を搭載したマルチモーダルデータベース「ViroScape」の開発

ViroScape: a Multimodal Database Integrating Viral Genomes, Epidemiological Information, and Host Response Profiles

川崎 純菜 ^1,2 、 布施 俊一郎 ² 、 角井 建 ^2,3 、 廣田 佳亮 ² 、 菅波 麻衣 ¹ 、 浜田 道昭 ⁴ 、 鈴木 忠樹 ^2,3 、 伊東 潤平 ¹

1. 大阪大学微生物病研究所附属バイオインフォマティクスセンター 2. 千葉大学大学院医学研究院 感染病態学 3. 国立健康危機管理研究機構 国立感染症研究所 感染病理部 4. 早稲田大学理工学術院

P2-46 ポスター発表

受賞者 田原-新井悠也

GEMS：適応的実験自動化に向けた実験プロトコルのMealy machineによる抽象化

GEMS: a Mealy machine abstraction for adaptive laboratory automation

田原-新井 悠也 ^1,2,3 、 落合 幸治 ⁵ 、 加藤 月 ⁵ 、 阿住 和哉 ⁴ 、 高橋 恒一 ⁴ 、 神田 元紀 ⁵ 、 尾崎 遼 ^2,3

1. 筑波大学 グローバル教育院 ヒューマニクス学位プログラム 2. 筑波大学 医学医療系 バイオインフォマティクス研究室 3. 理化学研究所 生命機能科学研究センター AI生物学研究チーム 4. 理化学研究所 生命機能科学研究センター バイオコンピューティング研究チーム 5. 東京科学大学　難治疾患研究所　ロボット科学分野

P2-64 ポスター発表

受賞者 植田大海

量子コンピューティング駆動型タンパク質デザインを可能にする、タンパク質配列の高精度バイナリ符号化モデルの開発

Protein language model-based binary AutoEncoder for enabling Quantum Computing-driven protein design

植田 大海 ^1,2 、 Andrejs Tučs ⁴ 、 津田 宏治 ^3,4,5 、 梅津 光央 ^4,6 、 齋藤 裕 ^1,2,3

1. 北里大学 2. 産業技術総合研究所 3. 東京大学 4. 理化学研究所 5. 物質・材料研究機構 6. 東北大学

P1-71 ポスター発表

受賞者 南直弥

ゲノム言語モデルを用いた種横断的エンハンサー予測AIの開発とがん耐性・長寿動物への応用

Genome Language Model-Based Cross-Species Enhancer Prediction for Cancer-Resistant and Long-Lived Animals

南 直弥 ¹ 、 伊東 巧 ^2,3 、 清水 秀幸 ^2,3 、 朱 子達 ¹ 、 北野 泰佑 ¹ 、 吉川 泰永 ¹

1. 北里大・獣医学部・獣医生化学 2. 東京科学大・総合研究院・AIシステム医科学 3. 東京科学大・院医歯学

P1-20 ポスター発表

受賞者 山本達毅

発現シグネチャーと遺伝子機能知識の統合型グラフニューラルネットワークによる摂動遺伝子予測

Graph Neural Networks Integrating Expression Signatures and Gene Knowledge for Perturbation Gene Prediction

山本 達毅 ¹ 、 櫻木 実 ¹ 、 小島 諒介 ¹ 、 奥野 恭史 ¹

1. 京都大学大学院医学研究科 ビッグデータ医科学分野

P1-66 ポスター発表

受賞者 大谷悠喜

創薬AI「AMP-Atlas」による中分子抗菌ペプチドの網羅的探索と進化的最適化

AMP-Atlas: AI-Driven Discovery and Evolutionary Optimization of Medium-Sized Antimicrobial Peptides

大谷 悠喜 ^1,2 、 宇垣 多恵 ² 、 青木 渉 ³ 、 上蓑 義典 ⁴ 、 清水 秀幸 ^1,2

1. 東京科学大学 総合研究院 M&Dデータ科学センター AIシステム医科学分野 2. 東京科学大学大学院 医歯学総合研究科 3. 慶應義塾大学病院 臨床検査科 4. 慶應義塾大学医学部 臨床検査医学教室

P2-51 ポスター発表

受賞者 太田垣匠

シュードノットを考慮したサンプリングベースの微分可能折り畳みモデルによる RNA配列設計

RNA Sequence Design Using a Pseudoknot-Aware Sampling-Based Differentiable Folding Model

太田垣 匠 ¹ 、 岩切 淳一 ² 、 寺井 悟朗 ^2,3 、 浅井 潔 ³ 、 佐藤 健吾 ¹

1. 東京科学大学 生命理工学院 2. 東京大学 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 3. バイオ生成AI研究開発センター データサイエンス共同利用基盤施設

P2-78 ポスター発表

受賞者 岩坂拓海

生体状態記述を志向した点群モデルによる赤血球情報統合法の開発

Development of a Point-Cloud-Based Erythrocyte Information Integration Framework for Biological State Characterization

岩坂 拓海 ¹ 、 中島 恵理 ¹ 、 本澤 龍紀 ¹ 、 水野 忠快 ^1,2

1. 東京大学　大学院薬学系研究科 2. 統計数理研究所

P2-84 ポスター発表

受賞者 中村尚暉

AIが導く腫瘍特異的な抗がん剤併用療法の選択

AI-Guided Precision Combination Therapy from Tumor Transcriptomes

中村 尚暉 ^1,2 、 大田 航平 ^1,2 、 伊東 巧 ^1,2 、 清水 秀幸 ^1,2

1. 東京科学大学総合研究院M&Dデータ科学センターAIシステム医科学分野 2. 東京科学大学大学院医歯学総合研究科

P2-86 ポスター発表

受賞者 浅田梨湖

ゲノム・生活習慣データに基づく疾患発症リスク構造のマルチモーダル解析

Multimodal Analysis of Disease Risk Structure Using Genomic and Lifestyle Data

浅田 梨湖 ¹ 、 櫻木 実 ¹ 、 戸﨑 泰誠 ¹ 、 鎌田 真由美 ² 、 奥野 恭史 ¹

1. 京都大学 医学研究科 ビッグデータ医科学 2. 北里大学 未来工学部 データサイエンス学科