日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IBMP2020)

ポスター発表

開催日時
9/1(火)16:30〜18:00(奇数)
9/2(水)16:30〜18:00(偶数)
Poster# Title Authors
P-1 Phosphorylation on an intrinsically disordered region regulates the DNA binding activity of a transcription factor via transient interactions. Kota Kasahara, Toru Sengoku, Qilin Xie, Yuta Nakano, Ryotaro Koike, Satoshi Fukuchi, Junichi Higo, Masafumi Nakayama, Kazuhiro Ogata and Takuya Takahashi
P-2 時系列トランスオミクス解析 芙美子 松崎, 新介 宇田, 幸代 山内, 雅記 松本, 朋義 曽我, 一満 前原, 恭行 大川, 敬一 中山, 真也 黒田 and 浩行 久保田
P-3 撮影条件の異なる細胞画像の領域検出におけるデータ拡張の有効性 弘晃 野崎 and 由佳子 遠里
P-4 Stratification of inflammatory bowel disease by mathematical analysis of gut microbiota Keisuke Ota, Ryo Yamaguchi and Shinji Nakaoka
P-5 Analyzing CG methylation in oocytes using deep learning (深層学習を用いた卵子におけるCGメチル化の解析) Wan Kin Au Yeung, Osamu Maruyama and Hiroyuki Sasaki
P-6 自家熱型高温好気消化プロセス(ATAD)における動態変化解明のためのショットガンメタゲノミクス解析 Natsumi Ishida, Yoshihisa Kawano, Yukihiro Tashiro and Kenji Sakai
P-7 The distributions of the words in human DNA Hayato Takahashi
P-8 転移学習された医用画像分類モデルの普遍的敵対的摂動に対する脆弱性 Akinori Minagi, Hokuto Hirano and Kazuhiro Takemoto
P-9 Evolutionary training protocols for deep representation learning of multi-domain proteins Hideki Yamaguchi and Yutaka Saito
P-10 精神疾患リスクと環境パラメータの関連性についての地理空間データ分析 Takumi Ito and Kazuhiro Takemoto
P-11 Data-driven selection of lung cancer-related genes by combination of unsupervised and supervised machine learnings Kota Fujisawa, Shinya Ikematsu and Ryota Miyata
P-12 Search for preventive drugs against anticancer drug-induced peripheral neuropathy using large-scale medical information Takahiro Niimura, Yoshito Zamami, Yuki Izawa-Ishizawa, Mitsuhiro Goda, Kimiko Fukunaga, Kenta Yagi, Masayuki Chuma and Keisuke Ishizawa
P-13 肺炎診断用深層ニューラルネットワークのバックドア攻撃に対する脆弱性 Yuki Matsuo, Hokuto Hirano and Kazuhiro Takemoto
P-14 統計的有意性を担保可能な系列パターンマイニングに基づく配列モチーフ検出ソフトウェアの開発 Koichi Mori, Haruka Ozaki and Tsukasa Fukunaga
P-15 Wide parameter space analysis for reproducible parameter sets in simple model Kentaro Inoue
P-16 機械学習を用いたRNA安定性予測モデルの開発 Emi Hattori, Takaho Tsuchiya, Hiroyasu Wakida, Kentaro Kawata, Yuta Yamaji, Youichiro Wada, Nobuyoshi Akimitsu and Haruka Ozaki
P-17 Detection of alternative splicings and the causative genomic variants with only transcriptome data Naoko Iida, Kenichi Chiba, Ai Okada, Raul Nicolas Mateos and Yuichi Shiraishi
P-18 Secure and Traceable System for Genomic Data Sharing Using Hyperledger Fabric Blockchain Koshi Ikegawa, Nao Nishijima, Yoji Ozawa, Katsuhiro Fukunaka, Hironori Emaru, Masaru Hisada, Akihito Kaneko, Eiichi Araki, Ai Okada and Yuichi Shiraishi
P-19 深層強化学習を用いた二次構造に基づくRNA配列の設計 Yuki Hotta, Yasubumi Sakakibara and Kengo Sato
P-20 ロングリードを活用したゲノムアセンブリ用新規スキャフォールディングツールの開発 Yuta Ishii, Rei Kajitani and Takehiko Itoh
P-21 3DCNNを用いたタンパク質予測構造モデル評価手法の進化的情報の利用による改良 佑真 武居 and 貴士 石田
P-22 パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング Ryohei Eguchi, Momoko Hamano, Michio Iwata, Toru Nakamura, Shinya Oki and Yoshihiro Yamanishi
P-23 低分子化合物によるパスウェイ制御を介したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング Toru Nakamura, Michio Iwata, Momoko Hamano, Ryohei Eguchi and Yoshihiro Yamanishi
P-24 Discovery of mRNA secondary structural features for the accurate prediction of protein abundance in Escherichia coli Goro Terai and Kiyoshi Asai
P-25 深層学習ネットワーク構造の検討によるタンパク質天然変性領域予測手法の改良 Kan Shiraishi
P-26 A drug–transcription factor–disease network focusing on regulatory mechanisms involved in gene expression Zhaonan Zou, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi and Shinya Oki
P-27 CellCellTopic:cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
P-28 蛋白質―ペプチド間相互作用の網羅的解析と結合予測への応用 Keiichiro Sato, Kota Kasahara and Takuya Takahashi
P-29 尿中揮発性有機化合物による乳癌の新規診断法の研究 Shoko Kure, Sera Satoi, Toshihiko Kitayama, Marina Yamada, Noboru Uchiyama, Satoshi Miyashita, Yuta Nagase, Nobuo Nakano, Jyunichi Koyano, Shinya Iida, Hiroyuki Takei and Masao Miyashita
P-30 HPOを活用した新たな創薬アプローチ 弘晃 六峰, 直政 吹田, 実穂 岡 and 裕介 中山
P-31 ChIP-seqデータベースの大規模解析で解明する細胞型ごとに多彩な転写因子認識配列 Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
P-32 臓器横断的な悪性腫瘍の遺伝子発現の特徴量による比較検討 Takafumi Ojima, Satoshi Nagaie, Ryosuke Ishiwata, Satoshi Mizuno, Hiroshi Tanaka and Soichi Ogishima
P-33 Single-cell transcriptome analysis reveals more direct and synchronized reprogramming to pluripotency by CRISPR activators Masahito Yoshihara, Joonas Sokka, Jouni Kvist, Laura Laiho, Andrew Warren, Chris Stadelmann, Eeva-Mari Jouhilahti, Aija Kyttälä, Juha Kere, Timo Otonkoski, Jere Weltner and Ras Trokovic
P-34 変分オートエンコーダとベイズ最適化を用いたアプタマー配列の選択 Natsuki Iwano and Michiaki Hamada
P-35 脳における細胞種特異的なDNA制御領域としての転移因子の役割 Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada
P-36 確率的生成モデルを用いた線虫初期発生の分節化 圭志 中谷 and 由佳子 遠里
P-37 マウス原腸形成期における遺伝子発現変化の時空間再構築 Yukitaka Isaka, Nen Saito and Chikara Furusawa
P-38 Generation of derivative for small organic compound via Monte Carlo Tree Search Daiki Erikawa, Nobuaki Yasuo and Masakazu Sekijima
P-39 新型コロナウイルスSARS-CoV-2におけるミステリー遺伝子産物ORF8相互作用タンパク質の系統プロファイル解析 啓 北川, 幸彦 久保田 and 將弘 伊藤
P-40 Co-expression network analysis of E3 ligase genes in embryonic stem cells and cell fate specification Darina Obukhova, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
P-41 PreNTS: Computational Prediction of Nitrotyrosine Sites by Integrating Sequence Features Andi Nur Nilamyani, Md. Mehedi Hasan and Hiroyuki Kurata
P-42 PubMed文献に基づく任意の用語に関連する遺伝子リストの導出及び順位付け手法の開発 大輝 新田 and 賢吾 木下
P-43 Single-step Retrosynthesis Prediction based on the Identification of Potential Disconnection Sites using Molecular Substructure Fingerprints Haris Hasic and Takashi Ishida
P-44 テンソル分解により二本鎖切断になりやすいヒト遺伝子の推定 Nobuo Hosaka and Y-H. Taguchi
P-45 摂動応答トランスクリプトームを用いた創薬標的分子と治療薬の探索 Satoko Namba, Michio Iwata, Midori Iida and Yoshihiro Yamanishi
P-46 がんゲノムの異種情報の統合による特徴量抽出と可視化 Azumi Okuda, Yuichi Shiraishi and Hidetoshi Shimodaira
P-47 Pfam事前学習モデルを用いた転移学習によるタンパク質の機能アノテーション予測 Tsukasa Nakamura and Kengo Kinoshita
P-48 Pup-Fuse: Improved Prediction of Protein Pupylation Sites by Integrating Sequence Information Firda Nurul Auliah, Md. Mehedi Hasan and Hiroyuki Kurata
P-49 The brain-derived neurotrophic factor Val66Met polymorphism increases segregation of structural correlation networks in healthy adult brains Issei Ueda, Kazuhiro Takemoto, Keita Watanabe, Koichiro Sugimoto, Atsuko Ikenouchi, Shingo Kakeda, Asuka Katsuki, Reiji Yoshimura and Yukunori Korogi
P-50 深層学習による食品ペプチドの健康効果の予測と作用機序の解明 Itsuki Fukunaga, Ryusuke Sawada, Tomokazu Shibata, Kazuma Kaitoh, Yukie Sakai and Yoshihiro Yamanishi
P-51 in silico解析によるarchitectural RNA共通特徴の発見 Saki Amatsu, Wataru Okada, Yu Hamaguchi, Chao Zeng, Masahiro Onoguchi, Takeshi Chujo, Tetsuro Hirose and Michiaki Hamada
P-52 Changes in nuclear architecture during the establishment of Piwi-mediated silencing Yuka W. Iwasaki and Haruhiko Siomi
P-53 Quality Assessment of Protein Structure Modelsusing Molecular Dynamics Trajectories Jason Kurniawan and Takashi Ishida
P-54 Comparative Sequence Analysis of Disome Positions using Orthologous and Paralogous Proteins Takuma Kobayashi and Kentaro Tomii
P-55 物質生産のための代謝コアネットワークの研究 Takeyuki Tamura, Ai Muto, Yukako Tohsato and Tomoyuki Kosaka
P-56 Development of preventive drugs for doxorubicin-induced myocarditis using large-scale medical database Yuki Nonin, Yoshito Zamami, Takahiro Niimura, Mitsuhiro Goda, Kimiko Fukunaga, Kenta Yagi, Masayuki Chuma, Yuki Izawa-Ishizawa and Keisuke Ishizawa
P-57 ニボルマブ由来のirAE大腸炎患者と潰瘍性大腸炎患者間における腸内細菌叢の比較解析 Kentaro Hashimoto, Hiroki Nishiyama, Toshiharu Sakurai, Tomoyuki Nagai and Hiroyuki Ogata
P-58 深層学習を利用した人工衛星によるリモートセンシングに基づく海洋微生物組成予測法の開発 Hiroto Kaneko, Kentaro Tomii, Ryosuke Nakamura, Hisashi Endo and Hiroyuki Ogata
P-59 深層学習を用いた漢方薬リポジショニングと作用機序解析 Akihiro Douke, Ryusuke Sawada, Michio Iwata, Yukie Sakai, Makoto Kadowaki and Yoshihiro Yamanishi
P-60 気象実測値を用いた茶樹摘採日の予測モデル Wei Cao, Junya Geshi, Kazunobu Okadome and Kouki Fujioka
P-61 RCGAToolbox: 生化学システムの動力学パラメータ推定のためのツールボックス 和勲 前田 and 博之 倉田
P-62 Subfamilies of mitochondrial pyruvate carrier genes were identified in Poaceae species through deep curation of the genomic sequences Shin Kore-eda and Susumu Mitsuyama
P-63 深層表現学習によるタンパク質の指向性進化と自然進化の関連解析 Shuzo Fukunaga, Hideki Yamaguchi and Yutaka Saito
P-64 サポートベクターマシンを用いた顕微鏡下凝集試験 (MAT) の自動化 Yuji Oyamada, Yasuhiko Nikaido, Satoshi Miyahara, Mitsumasa Saito, Sharon Villanueva, Toshiyuki Masuzawa and Ryo Ozuru
P-65 転写リードスルーが生じる遺伝子のエピゲノム修飾解析 Keisuke Tsujita, Junichi Iwakiri and Kiyoshi Asai
P-66 電子カルテ情報の分析による抗菌薬治療戦略の最適化 Sanetoshi Yamada, Mayumi Tanahashi, Yoshiro Yamamoto, Tohru Ishihara, Hidetaka Yanagi, Masayuki Oki, Hideki Ozawa and Tadashi Imanishi
P-67 自由エネルギー計算を利用した薬剤標的相互作用予測手法の検討 駿也 杉田 and 雅史 大上
P-68 非代償性および代償性心不全患者における腸内細菌および血漿の細菌関連代謝産物 高橋 知也
P-69 Feasibility study of developing a system to extract new reported adverse drug events on a daily basis from MEDLINE for pharmacovigilance Yutaro Okano, Matsuyuki Shirota and Kengo Kinoshita
P-70 パブリックデータベースを用いた亜急性期全身性炎症反応症候群における単球由来サイトカイン産生の評価 寿健 松本, 裕司 小倉 and 岳士 嶋津
P-71 全ゲノム遺伝子共発現情報の可視化手法の検討 Takeshi Obayashi, Yuichi Aoki and Kengo Kinoshita
P-72 非対称な相互作用をもつマルコフ確率場を用いた非剛体イメージレジストレーション技術 徹 長村 and 旭将 徳永
P-73 Detecting somatic mutation from noisy long read sequencing data Kenichi Chiba, Yuki Saito, Keisuke Kataoka and Yuichi Shiraishi
P-74 Association between cytokine gene expression and neurological outcome in post-cardiac arrest syndrome using publicly available database Shunichiro Nakao, Hisatake Matsumoto, Hiroshi Ogura and Takeshi Shimazu
P-75 Coexpression-guided Generative Model for the Understanding of Plant Gene Expression State Space Yuichi Aoki, Shinichi Yamazaki, Takeshi Obayashi and Kengo Kinoshita
P-76 ヒト転写因子の標的遺伝子の特徴とエンハンサー・遺伝子相互作用に関わる転写因子解析 直樹 大里
P-77 Generating annotation texts of HLA sequences with antigen classes by a T5(Text-to-Text Transfer Transformer) model using International Nucleotide Sequence Database Eli Kaminuma, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara, Masanori Arita and Yasukazu Nakamura